Не сочтите за занудство .. )
Atmega 324PA доктор определяет правильно как 1E 95 11,
Но ставит фьюзы 62 99 FF. Тем самым отключая некоторые порты и включая Ятаг : "JTAG enabled(portc.2-portc.5 not usable)".
Большой проблемы в этом нет, это легко поменять в последовательном программировании.
Тогда Fuse становятся 62 D9 FF, все порты работают в обычном режиме. Хотя из даташита я не смог понять в каком состоянии поставляется этот фьюз.
27.10 Programming via the JTAG Interface Programming through the JTAG interface requires control of the four JTAG specific pins: TCK, TMS, TDI, and TDO. Control of the reset and clock pins is not required. To be able to use the JTAG interface, the JTAGEN Fuse must be programmed. The device is default shipped with the fuse programmed. In addition, the JTD bit in MCUCR must be cleared. Alternatively, if the JTD bit is set, the external reset can be forced low. Then, the JTD bit will be cleared after two chip clocks, and the JTAG pins are available for programming. This provides a means of using the JTAG pins as normal port pins in Running mode while still allowing In-System Programming via the JTAG interface. Note that this technique can not be used when using the JTAG pins for Boundary-scan or On-chip Debug. In these cases the JTAG pins must be dedicated for this purpose