Vslz

все три (а иногда и больше) ноги у транзисторов одинаковы. Да, конечно, будет под напряжением. А как же ? На контактах выключателя освещения в цепи лампочки, пока он выключен, тоже есть напряжение сети. 
поставьте теплопроводную прокладку (есть под разные корпуса, разной теплопроводности и эл. прочности), тогда не будет
Канал мосфета при открывании включается параллельно боди-диоду и падение напряжения становится намного ниже чем с просто диодом. Синхронное выпрямление.

можно снять динамик и аккуратно попытаться покачать диффузор. Возможно, катушка звуковая от перегрева вспучилась и отклеилась. Где то задевает.

Такой регулятор не подходит для вентилятора.
Вентилятор работает с постоянным напряжением, а вы подаете импульсное. Случайно получилось, у друга/брата/вчера/в ютубе/.../ работает, а у меня нет - не аргумент.
Если регулятор не регулируется при подаче постоянного напряжения питания 0..Uном, то и подача ШИМ в цепь питания не поможет. Значит, у вентилятора просто есть отсечка по пониженному напряжению питания.
А если регулируется постоянным, то из ШИМ очевидно, просто надо восстановить постоянку LC цепью. Дроссель на колечке микрометалс (100-500мкГн) и конденсатор (470-1000 мкФ). Расчет даст точные цифры.