Причем тут бит? с фотоприемника приходит лог 1 либо лог 0,когда сигнал переключается из 0 в 1 либо из 1 в 0 происходит прерывание PCINT,а у вас это не отслеживается ,а у автора отслеживается
SIGNAL:
IN STAV,PINY3
COM STAV ;инвертирует входной сигнал (приемник в состоянии покоя log1)
;Низкий уровень
SBRC STAV,1
RJMP NE_10
LDI REG,0
OUT TCNT0,REG
NE_10:
;Верхний уровень
SBRS STAV,1
RJMP NE_01
IN REG,TCNT0
....
Понятно,что устанавливается предделитель таймера0,от этой частоты и работает таймер,и если как у вас установить предделитель на 64 то таймер0 будет тикать каждые 64 мксек
В авторской прошивке установлен режим стс