Возможно, мало кому приходилось сталкиваться с подобной проблемой. В данном случае производитель платы требует, чтобы файлы документации были в формате Sprint-Layout. Проблему удалось решить следующим образом.
1. При генерации гербер файлов в KiCad, для режима черчения, необходимо выбрать пункт "Использовать начало координат сверловки/размещения". Это позволит автоматически совместить рисунок Gerber и сверловку.
2. При генерации файлов сверловки не надо выбирать десятичный формат нулей. Начало координат - Абсолютные. Ед. измерения сверла - Дюймы.
3. И самое главное! Sprint-Layout может импортировать полигоны, но не очень большой площади. Экспериментально определено, что не более ~2500 мм2. Поэтому большие полигоны можно разбить на ряд маленьких, состыкованных с нулевым зазором.
4. Часть контактных площадок импортируется нормально, а часть в виде неких артефактов, представляющих собой фрагменты дорожек. На последующие герберы это, скорей всего, не окажет существенного влияния. Но я затратил ещё немного времени и заменил эти артефакты нормальными контактными площадками.
Вот так полигоны прорисовываются в Sprint-Layout. Ручками, как это многие советуют, такого не сделаешь.
