чтобы что-то понять нужно снять растянуто этот выброс - сколько импульсов идёт большой ток, какая амплитуда, какая длительность этих импульсов.
скорее всего отсутствует софт старт, поэтому регулятор раскрывается полностью в начале.
скорее всего тк напряжение на выходе есть какоето, то регулятор не раскрывает скважность на полную, а держит меньшую длительность импульса
Несколько замечаний:
-флай на мощность более 100Вт это моветон вобщемто, лучше другую топологию применить
-софт старт можно и по вторичке сделать - в виде специальной обвязки тл431
-советую разравнивающие резисторы на выходные диоды поставить
-1000пф многовато, действительно трансформатор может насыщаться, тк ограничения длительности импульса нету наверное у этой микры
