@alexTSMD в электронике не бывает чудес.
Если плата исправна, ничего на ней в процессе замены аккумуляторов не было повреждено, то она работает так же, как и прежде.
Пиковый ток при пуске мотора с новыми аккумуляторами не больше, чем со старыми, когда они были новыми. И защита тогда не срабатывала.
Сейчас срабатывает защита. Было бы неплохо понять, по мин напряжению или по току.
Особых причин, чтобы ток стал больше, нет. Значит, остаётся вариант просадки напряжения на батарее из-за состояния или качества аккумуляторов.
Я так вижу ситуацию. У Вас есть другое какое-то объяснение? А то Вы вместо рассуждений просто твердите, что аккумуляторы железно отличные безо всяких проверок (тест зарядкой на малых токах не в счёт).