Наверное можно так .
Зарядить предварительно ионистор от 3В и посмотреть работу платы . Как она мигает и сколько потребляет, когда светодиод выключен .
Или проверить работу не от ионистора, а от двух (лучше трех) батареек (по 1.5B), соединенных последовательно .
При напряжении менее 2B AVR обычно не работают , особенно, когда они подключены через стабилизатор .